島上軍以科餉為名，縱橫衍蔓，上游延建俱有海兵出沒。
閩撫佟國器密疏成功異志，恐以撫始終自誤。上密勒福省督撫鎮將，嚴飭守備，毋墮彼計。
其年夏秋，晉王定國自廉州出師，下高州，拔高明，圍新會，廣東震動。定國遣使成功請婚，且趣師。十月，使輔明侯林察總督南征，會晉王攻廣州，閩安侯周瑞憚不敢進，於是西師大敗。成功怒，欲斬瑞，諸將為請杖八十，革其職。
十一月，漳州守將以郡城約降。成功自思明州入海澄，夜勒兵，諸將未知所向，四鼓直抵漳城，開門迎入。守將樸世用、魏標、魏其志、知府房星耀、知縣周瓊、李奇生、范進等降，泉州諸縣望風潰。成功復取同安。未幾，甘輝攻仙游縣，開地道入之，屠掠幾無遺，和議遂絕。
大清命烏金世子統大軍入閩。乙未夏五月，成功遣忠振伯洪旭，北鎮陳六卿，取舟山，守把巴臣興舉軍降。以六御守舟山，洪旭攻台溫，召臣興歸思明。六月，墮安平鎮及漳郡、惠安、南安、同安城撤兵，聚思明。以貝子將至，權清野斂戍也。
晉王定國復致成功書。
十二月烏金世子至泉州，遣人賚論至思明招降，不納。易函稱書，以祖大壽，洪承疇為辭，成功依違答之。丙申三月，貝子會泉州水師攻兩島，成功遣林順，陳澤以炮舟出御。大舟先為颶風所飄，多登而遁，十餘人浮至金門。斷手刖耳鼻遣之。
別將攻白沙，不克而還。
六月，前衝黃梧以海澄來降，封海澄公。海澄軍儲多，成功使王秀奇、統黃梧、蘇明同守。明兄茂先為施瑯副將，瑯之得罪也，茂實逸之。及茂從黃廷、黃梧人揭陽失利，遂軍按法誅茂，並梧戴罪，故梧、明皆怨成功。貝子之入閩也，漳泉屬邑皆下，惟海澄未復，梧、明憚秀奇，不敢動。適秀奇出計事，二人遂舉城降。
時貝子重兵在漳，成功議率眾北向以肄之，剋期解纜。聞海澄變，諸將皆失色，成功奮然曰：“吾欲圖大，豈以澄邑阻事？有不行者斬！”遂揚帆下閩安鎮，省會震動。督撫出王進於獄，使治守具。南軍屢攻不利，乃城牛心塔，以陳斌戍之。
梧封海澄公。明母猶在海上。召明入京為內大臣，梧因獻平海策：請發鄭氏塚，誅求親黨，設五商及遷海等事。
成功用法嚴，其下常懼誅，禮官陳寶鑰、黃開泰，先後出降，大清輒貴顯之，以招島上人，島上人多動心。然降將亦慕成功賚子殊渥，第宅供帳，與已無異。以故郝文興等，迄死不貳。
是年，台州鎮將馬信，寧波鎮將張私德，降於成功。各予白金五千兩，蟒衣玉帶一，信母妻各白金五百兩，珠冠霞帔一。
是年，晉王定國奉桂王入雲南。八月，大軍復舟山，總制陳六御，英義伯阮駿死。丁酉春正月，晉王定國率兵討孫可望，可望來奔。三月，定國公鴻逵卒於金門。大軍復閩安鎮，島將引還。陳斌孤軍守牛心塔，不得出。遣人招降，至福州，殺之，屠其軍甘輝等還自閩安，攻寧德，滿將阿克襄赴援，恃其驍勇，輕進，馬蹷，裹創步戰，為輝所殺。
戊戌，成功議大舉取南京，曰：“據長江則江南半壁，皆吾囊中矣。”諸將多言南京道遠城固，須數萬人，不如近攻完利。惟馬信力贊，乃以黃廷為前提督，洪旭為兵官，鄭泰為戶官，居守思明。自率中提督甘輝、後提督萬禮、武衛林勝、統領餘新虎、衛左鎮陳魁、水陸甲士五萬，號十萬，舉帆入浙。
攻陷樂清諸縣，將進長江；次羊山，暴風覆舟，亡數千人。退泊舟山，整固舟輯，以圖再舉。
桂王遣周金湯由廣東龍門航海，至思明，封成功為延平王，諸將升擢有差。成功以未有恢復功，辭王爵，稱招討大將軍如故。是年，大清師入貴州，李定國、白文選等皆敗。
已亥五月，成功全軍北出，抵崇明，以兵部尚書張煌言嘗從定西侯名振三入長江，知虛實，用為前驅。煌言請定崇沙為老營，不聽。金焦沿江置炮，島人乘南風盛，徑抵瓜洲城下。
我師出御，死者千餘，乘勝克其誠。以柯平為同知，守瓜洲。
成功留攻鎮江，令煌言先搗觀音門、儀真，官民迎降。六月廿四日，鎮江軍陣江口，成功登陸擊之。戰未合，周全斌率所部先登，陷陣。時大雨濘，騎皆陷於淖，海上軍徒跣擊刺，往來剽輕，我師竟敗。提督管效忠走，朱操江被執，江南北大震。
成功入城，以全斌違令先動，將殺之，諸將力請，乃免。於是全斌帶傷守鎮江。七月，成功進圍南京，移檄遠近。
張煌言至蕪湖、廬鳳、甯、徽、池，太守令將吏，日納款軍門，凡得府四、州三、縣二十四。金陵守禦雖堅，亦欲議降。
煌言將向江西，馳書勸成功急攻南京，而分兵下▉成功不許。
崇明副將梁化鳳先已降，又不時調化鳳偵丹陽無備，遂引兵突入南京，乘南軍怠，夜開城出，大有斬獲。次日，滿漢軍傾城出戰，襲破餘新軍，諸軍皆潰，爭赴舟，溺死無算，成功僅得登舟。獲都督甘輝，殺之。
成功收潰軍，猶數萬人，揚帆出海，並棄瓜鎮。鎮江書生羅子木，抱成功足涕泣請留，不聽。奉其父以從。成功攻崇明
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