全面战争爆发，瞳兽们周而复始的向着边缘扩散，这其中死掉，啃食尸体，以及被人们所消灭的数量可谓空前。人们也开始研究着他们的这个可怕的对手。终于，一个契机出现了。在无数的瞳兽死亡后，无数的尸体被啃食后。这些一只眼的瞳兽中，有些渐渐的长出了第二只眼。长着两只眼的这些家伙们，适应了空气，再也不会在空气中死亡，再也不需要依赖黑烟而生存。虽然两只眼能适应空气，但对于枪弹炮火还是一样没有抵抗，这算是不幸中的万幸。不过这也是最糟糕的情况，因为接下来如果这些两只眼的瞳兽死掉，夜以继日的啃食这些瞳兽尸体的其他瞳兽们就会逐步的免疫。当然这也是一个契机，一直困扰着人类科学家们的问题得以解开。那就是眼睛，如果说一只眼睛是瞳兽的基本标配，那么两只眼睛就会给它提供一种新能力，换句话说就是它们进阶了。两只眼睛的瞳兽获得了在空气中生存下去的能力。就像一个兵，如果手枪是标配，那么如果给他一架飞机，他就成为可以在空中射击的兵。
这一发现，让所有研究人员从之前的研究瞳兽，转为了研究它们的眼睛，这无疑是确立了正确的研究方向。与此同时，军部在杀死二阶瞳兽（两只眼的瞳兽）后，也会尽力的回收这些瞳兽的尸体；一方面是用作研究，另一方面则是减缓这些家伙进阶的速度。之后的战争，进入了白热化。在此期间二阶的瞳兽越来越多，它们的能力也不尽相同，有的是适应了空气，但是却死于枪弹；有的则是适应了枪弹，却死于空气。两者达到了一个奇妙的平衡，越来越多的二阶瞳兽死去，人们的研究也取得了长足的进展。人们研究瞳兽的眼睛，发现了眼睛的瞳孔周围，有着一圈奇怪的纹路人们称之为瞳纹，拥有相同能力的瞳兽，其瞳纹排列相同。这就像一组被刻印在瞳孔周围的基因密码，为后来啃食它们尸体的同伴留下了进阶的方向。
人们试着提取这些瞳纹，进行比对研究。而比对的对象，就是人类。这项研究一直秘密的进行着，因为这是最坏的打算。当科技无法战胜瞳兽，就只有靠相同的基因手段，制造出基因战士做最后的一搏。研究发现，这些瞳纹的基因排列，其中有一部分的碱基和人类是相同的。假设将人类这部分碱基抽掉，在植入瞳纹的碱基和排列顺序，就有可能靠着这部分相同的碱基，连接两组完全不同的基因排列；而如果连接上的这些瞳纹基因得到激活，就可以开启人类自身的另一面，那将是拥有和瞳兽一样变态适应能力的另一面；不仅如此，我们和瞳兽相比，还具有着独一无二的东西---智慧。如果真的成功，这无疑是可以逆转现在的战争局势，甚至随着瞳纹基因的进阶，说不定终有一天可以战胜它们。不过，这项研究还不成熟，同时也还未被批准。毕竟所有人都看到了，瞳兽变态的适应能力，以及瞳纹的进阶，都是伴随着巨大的牺牲。而用之在人类身上，因为本就是不同体，再加上是双基因运作。如果抽离碱基后，植入的瞳纹基因没有被人体的基因接受和连接，那么作为人类本身就会因为失去这部分碱基而发生不可控的变异，甚至是死亡。
然而，有些事，有些方法即使再不忍，多无奈但还是要做要用；因为那是唯一解救的办法。与瞳兽的战争持续了十年，人们从没想过可以坚持这么久，也不知道还能坚持多久。这十年，瞳兽没有得以扩张它的“领地”，随着战争的愈演愈烈，二阶的瞳兽越来越少，直至九年前，至今过去了整整一年，没有出现过任何一只二阶的瞳兽。这是一个极坏的消息，因为它们打算一次性进阶。是的，三阶瞳兽在过去了十年后，终于出现了。它免疫了枪弹，可以在空气中自由的行动。三阶瞳兽越来越多，战局越来越不利。最后，最高会议在中心城市召开。这是一场公开会议，会议过程内容全部通过全息影像传达到每一个地方，所有人都可以看到。而会议的内容就是，是否要启动基因移植计划。
会议开始，在说明了基因移植计划的风险后，所有人沉默了。就现今而言，如果不启动这项计划，对于三阶瞳兽便束手无策，每一分钟，前线抵御着的人们便会出现牺牲；每失去一片土地，就会泯灭一寸土地上的生命。民众也沉默了，他们一个个都在犹豫着。如果这项计划实施，那么实验对象就是他们无疑。没有谁愿意把生命堵在这样毫无把握的试验上。会议进行了一天了，瞳兽已经扩大了较之前整整一倍的“领地”，而会议仍在进行，每一位议员都是出于崩溃的边缘，如果同意，那么可能就会有数以亿记得同伴死去；如果不同意，文明的灭绝就成了必然。即使部分人可以逃离地球，那也成了在无尽宇宙中流浪的流浪者。这个伟大辉煌的人类文明，会就此终结。会议持续到了第二天，最终，所有人同意了基因改造计划的执行。但是，却把决定权交还给
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