督院，指的是两广总督部院，闽浙总督部院，这是明代总督衙门比较正式的称呼，而抚院自然是巡抚衙门的称呼。
崇祯皇帝之所以将开海之后市舶司关税收入，向两广和闽浙等地的督抚分成，就是为了以让利来减少阻力。
朝廷和地方的督抚们利益均沾，这个事情推行起来也能够顺利一点。
再者说，地方督抚们在财政上若是没有一点自主权，没有一点财源支撑，交给他们办的很多事情也确实很难办，比如说督标、抚标的编练。
现如今，凡是崇祯皇帝新任命的总督和巡抚，陛辞之际，他都会授予他们编练督标和抚标的权力，督标三千员额，抚标两千员额。
这么做是为了让这些新任的总督和巡抚们，到任之后能够站稳脚跟，并且面对地方的军阀或者将来的流贼之时，能够有自保和镇压的能力。
但是，编练军队是要花钱的，而且还不是一蹴而就的投入，而是长期的源源不断的投入，若是没有一个稳定的财源，这样的投入又如何能够持续下去？
而对于两广和闽浙而言，开海通商，设立市舶司，向来往海商收取税银，就是一个比较固定的一个财源。
将督抚自身的权力和需要，与开海通商捆绑在一起，可以说是一举两得。
内阁首辅李国鐠等人见皇帝已经想得如此细致，心下当然也就知道了，开放海禁、鼓励海贸这件事情，恐怕在皇帝的心里已经酝酿很久了，当下再不迟疑，立刻躬身拱手说道：“臣等遵旨！”
崇祯皇帝召见南居益，本来是为了向他交代一番接任直隶总督之后的注意事项，结果，最后变成了内阁与军机处诸臣共议开海之事，等到南居益拜辞离去的时候，时间已经过去了大半天，而此时此刻，毕懋良也已经在乾清门外等了大半天了。
崇祯皇帝只好匆匆将毕懋良传进来，向他嘱托了几句户部仓场总督应该注意的事项。
毕懋良久在户部任职，同时也因为铸造崇祯银元的事情，与皇帝接触颇多，知道皇帝一贯的思路，因此也很明白皇帝“高筑墙”“广积粮”的意思。
所以，不大一会功夫，毕懋良即陛辞而出，与南居益前后脚奔赴通州上任而去。
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