英雄们本打算推举最伟大的赫拉克勒斯做首领，但他拒绝了，于是伊阿宋被推选为首领。后来又选提费斯为舵手，能看见地面上的一切也能看透地层下面的林叩斯任领航。
一切准备就绪，诸位英雄向阿波罗和其他神祇最后一次献祭品，然后踏上了征程。
阿耳戈船英雄在雷姆诺斯岛
在阿耳戈船英雄起航的第二天，就被一阵飓风，送到了鲜花盛开的雷姆诺斯岛。这座岛由年轻的女王许普西皮勒统治着，岛上没有一个男子。一年前，雷姆诺斯岛的妇女因丈夫从色雷西亚娶来许多女子，而将他们统统杀死，当时许普西皮勒饶恕了父亲——当时的国王托阿斯。从此以后，这里的妇女便担心色雷西亚人的报复，因此日夜提防。
因此，当阿耳戈船英雄在雷姆诺斯港口靠岸时，看到的是一群全副武装的妇女。英雄们派使臣手持象征和平的权杖，表示自己和平的愿望。许普西皮勒女王不打算让阿耳戈船英雄进城，她担心这些人知道她们犯下的暴行。但是年老的波鲁克索认为，不但应当让阿耳戈船英雄进城，更应当将他们留在岛上与这些女人共同生活。
听了老太婆的话，雷姆诺斯岛的妇女立即派一名女人同阿耳戈船使者共同去请这些英雄进城。
伊阿宋披上雅典娜亲自为他织就的豪华紫袍，动身进城。女王许普西皮勒极为热情地接待伊阿宋，留他在自己宫中安顿下来。阿耳戈船英雄大都进了城，但赫拉克勒斯和为数不多的几人仍然留在阿耳戈号上。
雷姆诺斯岛上迅速升腾起一片喜悦欢快的空气。众神敬献祭品的篝火熊熊燃烧，庆祝活动和喜庆宴会接连不断。阿耳戈船的英雄们在雷姆诺斯岛开怀畅饮，大吃大喝，完全沉浸在喜悦中，将等待他们去建立的伟大功勋抛诸脑后。为了尽早起航，赫拉克勒斯暗地里将阿耳戈船英雄聚集到大船旁，怒斥他们沉迷在享乐中抛却了建立功勋的重大责任。其他人听了他的话惭愧不已，心悦诚服地反省了错误。决定立刻离开雷姆诺斯岛。英雄们做好起航的准备，正要划桨开船，雷姆诺斯妇女突然成群结队地拥到海边，向英雄们恳求留在雷姆诺斯岛上，不要抛弃她们。但阿耳戈船英雄们早已下定决心，雷姆诺斯妇女只得服从命运的安排。伊阿宋第一个登上阿耳戈号，其他人紧随其后，划动船桨，阿耳戈号如同小鸟般飞向浩瀚的大海。
阿耳戈船英雄在基奇科斯岛
阿耳戈船英雄航行到了普洛滂提斯，停靠在基奇科斯岛稍作休息。国王库最科斯统治着海神波塞冬的后裔多利俄涅人。在基奇科斯岛的一座熊山上，住着一群野蛮的六臂巨人。但多利俄涅人在波塞冬的保护下，与巨人相安无事。库最科斯热情地接待了阿耳戈船英雄，举行了一整天欢乐的宴会。到了第二天凌晨，英雄们才准备继续上路。但他们刚上船，六臂巨人就突然出现了，他们往海里投下巨大的石块，还大块大块地撕下山岩堆在海中，以阻挠阿耳戈船英雄们的行程。赫拉克勒斯拉开自己的硬弓，将这群巨人们一个个射倒在地。其他英雄也纷纷以盾牌掩护，紧握长枪冲向巨人。没有多长时间，巨人们就被消灭了，没有一个幸免。
阿耳戈船英雄再次出发。海风将船帆鼓起，吹着阿耳戈号劈波斩浪地顺利航行了一天。但到了晚上，风向变了，阿耳戈号又被吹回基奇科斯岛的海岸。阿耳戈船英雄在黑暗之中上了岸。基奇科斯岛的居民没有认出他们，把他们当作海盗发起了进攻。双方展开了一场不幸的厮杀。在战斗中，英勇无比的伊阿宋将长枪扎进了国王库最科斯的胸膛，国王就这样被朋友杀死了。等到晨光女神厄俄斯用阳光将东方染成一片通红。明亮的日光才使得交战双方认出彼此，大家心中感到无比惊骇。阿耳戈船英雄与库最科斯居民心中无限悲痛，共同为死者举行了三天悼念仪式，他们恸哭不已。美丽的王后克里忒——墨洛普斯的女儿，因丈夫死悲痛欲绝，饮剑自尽了。
阿耳戈船英雄在密西亚
又经过一段时间的航行，阿耳戈船英雄抵达密西亚海湾。他们在这里靠岸停船，打算补充淡水和食物。赫拉克勒斯走下船，进入离岸不远的树林中，他想找一棵结实的松树来替换航行中不经意折断的船桨。不久，他找到一棵很好的冷杉，于是用强有力的双手抱住杉树，把它连根拔起。就在他扛着杉木向海边走去时，他的朋友波吕斐摩斯突然迎面跑来，告诉他许拉斯不见了，于是他们共同寻找许拉斯，但是一直没有找到。
启明星缓缓升上了天空，阿耳戈船英雄准备起身出航，由于当时天色昏暗，谁也没有察觉赫拉克勒斯和波吕斐摩斯没在船上。直到黎明大家才发现，这两个最出色的伙伴不见了，大家都感
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