龚德树于1857年3月围攻霍丘，歼灭清军800余人。旋与苏天福奉命迎接自六安北上的陈玉成、李秀成所部太平军，两军在霍丘与六安交界会师。不久与太平军一度共克舒城及桃镇，嗣退出。11月，率部在六安独山镇大败安徽布政使李孟群。
1857年春天，李秀成与陈玉成击败清军秦定三部，北上六安、霍丘，与捻军会合，兵锋直指湖北。
咸丰七年（1857年）春，侯士伟留在雉河集，与黄旗张敏行部联合。红旗与黄旗曾与李成、赵浩然等远征山东等地，并协助张敏行部经营浍北诸圩。苏天福、张乐行两路大军联合渡淮作战，攻占商业重镇三河尖，与太平天国陈玉成﹑李秀成军会师霍丘和正阳关。张乐行等捻军从此以听分封不听调用为条件，接受太平天国领导，配合太平军作战，但不接受改编。接受太平天国封号和领导，改换太平天国旗帜，张乐行被封为征北主将，后改封沃王。洪秀全敕封苏天福为“立天侯”。与太平军并肩战斗，使清证府大为恐慌，先后派胜保、袁甲三等人镇压捻军。此后，苏天福部队和太平军在江淮地区联合作战长达5年之久，有力地支援了太平天国起义。先后攻克霍丘、定远等县城，连败清军，积功封为后将军，晋爵扫北王。不久，太平军撤离，张乐行只好率军北上，控制了淮河中游地区。第二年夏天，配合太平军攻占定远，不断扩大占领区，向河南、苏北、山东出击，歼灭清军。
1857年，咸丰七年三月三日，孙葵心围攻霍邱，与太平天国将领李秀成、陈玉成会师于霍邱城外，接受其领导。是年十月，张乐行困守正阳关，孙葵心与龚得树、李昭寿增援，张乐行得以突围到六安。但由于组织松散，武器简陋，缺乏训练，因而在参战清军由少变多，捻军由进攻转为防御后，只有张乐行等少数几支主力于正面阻击清军，余多守寨自保，致使雉河集根据地被清军攻占。1857年春，张乐行率捻军渡淮南下，与北上的太平军陈玉成、李秀成部会师，接受太平天国领导，与太平军联合作战，在淮河两岸抗击清军围攻，并一度攻入湖北。
三月初，他们在霍丘、六安交界地区同太平军会师。两军会师淮南，是和当时形势分不开的。捻军因为受到清兵的沉重压力，必须争取太平军的帮助；太平天国由于一八五六年的天京变乱，力量大为削弱，急需团结友军一致对敌。共同的斗争把他们联结起来。张乐行意识到这一点，主动派龚得树、苏添福等迎接太平军；太平军豫天侯陈玉成、合天侯李秀成等也率部北上应合捻军。通过这次会师，捻军在一定程度上接受太平天国的领导。两军旌旗齐奋，向敌人发起强大攻势，占领了安徽正阳关和霍丘，取得初次战果。
第二次鸭片战争结束后，清证府调僧格林沁率部由直隶南下攻捻。捻军先后在巨野羊山集、菏泽李家庄、汶上杨柳集三败清军。
1857年7月16日，在清军先是攻陷句容，12月27日又攻陷镇江和瓜洲。
9月，洪秀全迫于形势的恶化，遣使请石达开回京，石达开上奏表示不会回京，但会调陈玉成、李秀成、韦俊等将领回援，并以“通军主将”身份继续为太平天国作战。洪秀全诏准了这一方案，天京官方遂承认石达开此后的作战是太平天国的远征活动。此后，石达开先后转战于天京外围的闽、浙、赣等省，牵制大量清军，缓解了天京、安徽两地的军事压力。
1857年底，张乐行所带捻军内部出现分歧，以蓝旗将领刘饿狼(刘永敬)为首的部分捻军坚持要回淮北，被张乐行等杀死。捻军于是分裂，大部分旗主返回淮北，只有张乐行﹑龚得等少数留在淮南，与太平天国保持着较密切的关系。还有一部分如孙葵心﹑张宗禹等，转战南北，曾深入河南﹑山东，推动了当地人民以各种形式起义反清。在皖北﹑苏北，捻军或协同太平军或独立作战，屡破清军。
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