泾县之屠
顺治三年、南明隆武二年（1646年）八月十七日，满清“提督”张天禄、“池州总兵”于永绶在南直隶泾县、徽州、绩溪县等地进行的一次大规模屠城。大约有五万人被屠杀。
赣州之屠
顺治三年、南明隆武二年（1646年）十月初四日，满清“江西提督”金声桓、“总兵”柯永盛在江西赣州府进行的一次大规模屠城。大约有二十万人被屠杀。
同安之屠
顺治四年（1647年）清军攻克福建厦门和同安县，然后屠城。福建同安县屠城死难5万余人，梵天寺住持无疑和尚收尸合葬于寺东北一里之地，建亭“无祠亭”，墓碑则刻“万善同归所”。
平海之屠
顺治四年、南明永历元年（1647年）七月，清军在福建平海卫进行大规模屠城。被屠杀的无辜百姓具体人数不详。
南昌之屠
顺治五年（1648年）清军包围南昌。次年三月间，南昌城陷，清军屠城。八旗军把从南昌掠来的妇女分给各营，昼夜不停的**。这些女性”除所杀及道死、水死、自经死，而在营者亦十余万。食牛豕皆沸汤微集而已。饱食湿卧，自愿在营而死者，亦十七八。而先至之兵已各私载卤获连轲而下，所掠男女一并斤卖。其初有不愿死者，望城破或胜，庶几生还；至是知见掠转卖，长与乡里辞也，莫不悲号动天，奋身决赴。浮尸蔽江，天为厉霾。“。这些事情记载在《江变纪略》里，此书是满清政府查禁的重点，在乾隆四十四年被明令销毁，靠着手抄本流传下来。而在清军陷城前，一些出来投降的汉人，也遭到了”男子分杀之，女子分留之“的命运。
顺治六年（1649年）清军再次占领江西南昌，下令进行屠杀。
邵武之屠
顺治五年、南明永历二年（1648年）五月，满清“福建左路总兵”王之纲在福建邵武县进行屠城，被屠杀的无辜百姓人数不详。
湘潭之屠
顺治六年（1649年）正月二十一日清军攻入湖南湘潭和沅州（今芷江），南明督师何腾蛟被俘。清郑亲王济尔哈朗下令在湘潭屠城，湘潭城百姓几乎全被杀光，城不满百人。沅州也遭到纵兵杀掠。
同安之屠
顺治五年、南明永历二年（1648年）八月十六日，满清“靖南将军”陈泰、“浙闽总督”陈锦、“福建提督”赵国祚在福建同安县进行大屠杀，大约有五万人被屠杀。
南雄之屠
顺治六年（1649年）农历十二月二十九日，清军抵达南雄，年三十除夕晚清军放火焚烧鼓楼，趁明军慌乱救火之际，攻入城内。对南雄县民大肆屠杀，“大清平、靖二藩克雄城，民尽屠戮，十存二三。”“家家燕子巢空林，伏尸如山莽充斥。....死者无头生被掳，有头还与无头伍。血泚焦土掩红颜，孤孩尚探娘怀乳。
信丰之屠
顺治六年、南明永历三年（1649年）三月初一日，满清“梅勒章京”胶商攻克广东信丰县，进行大规模屠城。
蒲城之屠
顺治六年、南明永历三年（1649年）四月初五日，满清“固山额真”李国翰攻克陕西蒲城县然后进行大规模屠城。大约有一万人被屠杀。
曹州之屠
顺治六年、南明永历三年（1649年）十月初四日，满清梅勒章京赖恼、沂州总兵佟养量、临清总兵宜永贵等攻克山东州曹州，进行屠城。被屠杀的无辜居民人数不详。
汾州之屠
顺治六年、南明永历三年（1649年）九月至十一月，满清“端重亲王”博洛、“和硕亲王”满达海等在山西汾州、太谷县、泌州、泽州等地进行规模屠城。大约有四十万人被屠杀。
大同之屠
顺治六年（1649年）清军在大同屠杀后，全城只剩下5个重案犯。满清派来的大同知府，书顺治帝，称既然没有了苦主，可以释放这5个人了。这份奏折，至今保存在第一历史档案馆。
广州大屠杀
顺治七年（1650年）清军攻广州，制造了庚寅之劫，”甲申更姓，七年讨殛。何辜生民，再遭六极。血溅天街，蝼蚁聚食。饥鸟啄肠，飞城北。北风牛溲，堆积髑髅。或如宝塔，或如山邱。五行共尽，无智无愚，无贵无贱，同为一区。“尚可喜屠广州，孑遗无留；逸出城者，挤之海。“死难十万至七十万人。
意大利籍耶酥会士卫匡国（ini，1614～1661）在《鞑靼战纪》记述:“大屠杀从11月24日一直进行到12月5日。他们不论男女老幼一律残酷地杀死，他们不说别的，只说:‘杀!杀死这些反叛的蛮子!”
荷兰使臣约翰纽霍夫（john nieuhoff）在其《在联合省的东印度公司出师国鞑靼大汗皇帝
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