二十一世纪初，‘保护伞’公司成为美国最大的商业帝国，大多数市民全部都使用它的产品。表面上‘保护伞’公司是北美屈指可数的军火和医药供应商，但公司却有一个连内部人员都不为知的秘密：在地底设置生化实验室开发非法生化病毒武器！
浣熊市城市底下就有‘保护伞’公司其中的一个生化实验室——‘蜂巢’。
一天不明原因导致‘蜂巢’启动了防御机制，‘保护伞’马修佣兵小队奉命到达‘蜂巢’取回智能系统‘红后’，防御机制关闭出入口的同时还释放神经毒气让吸入者持续四小时完全昏迷，同时还附有因人而异的不稳定失忆。
马修小队在入口抓住了新职的警员麦特和发现‘保护伞’公司‘蜂巢’入口大楼高级保安艾丽丝，佣兵小队进入时还将大门设置了永久关闭安全门的时限，在通往‘蜂巢’的列车里还发现了思班斯。
马修小队在进入主机通道时被激光通道杀死马修、医务兵和俩名佣兵，佣兵蕾恩、杰迪在外留守，技术佣兵卡普兰冒险进入主机房关闭‘红后’取出主板，主机重启将囚禁的怪物放了出来。
感染病毒的人类——丧尸；感染病毒的犬类——丧尸犬；在攻击围攻丧尸时意外放出的——舔食者（捕食者）。
被丧尸包围走散，艾丽丝知道了麦特是抵抗‘保护伞’公司组织的一员，她救他时打死的丧尸就是他妹妹，他也是为他妹妹假冒警察来到这里的。
艾丽丝带着麦特回到主机房后重启了‘红后’才知道导致‘蜂巢’启动防御机制是病毒泄漏，‘红后’遵守程序防止病毒泄漏到地面才启动防御机制导致所有‘蜂巢’里的遗传学、生物工程学专家及所有人员变成丧尸，同时也知道了丧尸的弱点，通过威胁‘红后’告诉了她们地下隧道的路径。
在地下隧道再次被大量丧尸包围，卡普兰与大家失散，艾丽丝记忆间断性苏醒知道了病毒解药，为了救治被咬伤了蕾恩，大家来到实验室被水淹没解药不见了，此时艾丽丝记忆再次苏醒知道自己就是麦特妹妹联系的内线，但她和她之间的交谈却被思班斯获知，思班斯抢先一步盗取‘t病毒’，为了毁灭证据离开时打破一支‘t病毒’，却不想‘红后’反应迅速在他还在列车上就启动了防御机制。
思班斯同时也苏醒了记忆，将艾丽丝三人关在实验室前往站台。
‘红后’引导舔食者到站台干掉恩班斯并突变，再引导它到实验室并要求艾丽丝消灭感染者——蕾思，却被赶回来的卡普兰关闭。
艾丽丝四人赶到站台拿起解药时杀死了变成丧尸的思班斯，列车在返回的途中因解药注射时间不及时蕾恩还是变成了丧尸被艾丽丝杀死，舔食者出退上来杀了卡普兰抓伤了麦特，在消灭舔食者到达‘蜂巢’出口时迎来一群穿着防化服的人员将俩人带走。
当艾丽丝苏醒走出空无一人楼发现外面如同暴发了战场一般……
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