孔执政仅三个月，就使鲁国内政外交等各个方面就均大有起色，国家实力大增，百姓安居乐业，各守礼法，社会秩序非常好，奸佞之人和刁民纷纷出逃。
同时，孔还通过外交手段，逼迫齐国将在战争中侵略鲁国的大片领地还给了鲁国。
孔一向主张“张宫室，抑私门”，所以为削弱三桓（季孙氏、叔孙氏、孟孙氏三家世卿，因为是鲁桓公的三个孙故称三桓，当时的鲁国政权实际掌握在他们手中，而三桓的一些家臣又在不同程度上控制着三桓），采取了堕三都的措施（即拆毁三桓所建城堡）。
结果触怒三桓之中的季氏，不得不离开鲁国，周游列国。在诸侯间宣扬自己的儒家学说，得到了很多人的支持。同时，孔提出儒家修身之法，养胸中浩然正气，长存人间。
六十八岁时，在弟冉秋努力下被迎回鲁国，被敬称为“国老”，国君与三桓时常请教于他。
当时天下公学把持教育，只有贵族可以学礼仪，明典籍。孔率先开始教授私学，提出“有教无类、众生平等”的学术思想。前后收的弟多达三千人，其中闻达于诸侯者有七十二人，人界将此七十二人合称七十二贤人。
孔又于邹国收得入室大弟孟柯、于赵国收得入室二弟荀匡，孟柯荀况二人皆有那天人之资，在拜孔为师后，继承发展了孔得儒家思想，却又推陈出新。其中孟柯发展了民本思想“民为贵，社稷次之。君为轻。”与仁政学说“劳心者治人，劳力者治于人。”正式将儒家带到庙堂之高。而荀匡继承了孔“后天教化”真传。提出了“人性本恶”论，强调后天环境和教育对人的影响。
儒家思想的大力发展，直接带动了诸百家的蓬勃发展，墨家、兵家、纵横家、阴阳家、法家等也加入了这个精彩的舞台。
晚年，孔垂垂老矣，于是专注于修改注释经典，修《诗》《书》，定《礼》《乐》，序《周易》，改《春秋》。
在改《春秋》时，鲁哀公十四年，西狩于大野。
叔孙氏家臣钥商获麟。
折其左足，载以归。叔孙氏以为不祥，弃之郭外，使人告孔曰：“有麋而角者何也？”
孔往观之曰：“麟也，胡为乎来哉”反袂拭面，涕泣沾衿。
叔孙氏闻之，然后取之。
弟贡问曰：“夫何泣也”
孔曰：“麟之至为明王也，出非其时而见害，吾是以伤之。”
因为思及自己出生时有麒麟现世，如今无端麒麟被杀，孔认为大不详，于是停止修改《春秋》。
并写下挽歌：唐虞世兮麟凤游，今非其时来何求？麟兮麟兮我心忧。此乃“获麟绝笔”之典故是也。
不久，其长孔鲤早逝，哀而成疾，与世长辞。
临死前悲呼“太山怀乎，梁柱摧乎，哲人萎乎！”
周天星辰抖动，万物悲鸣，诸弟尊孔为孔圣人。孔立儒门、创私学，开创了中国历史的平民教育的新时代，促进了人族的发展，有功于天地，在此功德圆满之际，天道降下海量功德，孔宣的本我意识苏醒，终于突破至准圣境界，斩出善尸孔。
头顶《论语》、《春秋》、《礼》、《乐》、《诗》、《书》吸收了功德之气，一股浓郁“仁爱”之气萦绕，成就功德圣器。孔随身数十年的春秋笔与君剑成为儒家传承至宝，承载孔一身的浩然正气，分别传给了孔的两位入室弟孟轲和荀匡。
孔拜别本尊孔宣，前往火云洞，拜见三皇，成就人族圣贤之位。在儒家至圣孔之后，还出了亚圣孟，荀等，至此儒门进入发展的**时期。
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