朝定得知太田资正大胜后就令他率领剩余人马去攻击古河御所。对于古河幕府军的俘虏，朝定让他们自己选择，想为上杉家效力的留下，不想的离开。结果，俘虏里有三千余愿意留下的，但是朝定不打算全部收下，只是挑选和精简一批。毕竟有饭吃谁不想留下？在两个时辰后，筛选下来的一千新军就编入了上州兵内，并且将他们打散编入。
也就在朝定挑选降卒的时候，太田资正就将早已人去楼空的古河御所拿下了。
梁田晴助等人由于丢下了自己的军势逃回古河御所，然而城内只有守军一百余，并没有多余的守军。他们将士气低下的本部人马和守军一百拼凑起来后就带着足利藤氏逃离古河御所，前往结城城。这结城城可是关东公方奉公众们造反的圣地。
当年，在永享十二年正月的时候，南关东下总国结城城的城主结城氏朝，因为对幕府不满，把四大家老水谷伊势守时氏、築田修理亮、築田将监和黑田民部丞喊来，以拥立足利持氏的两个儿子春王丸与安王丸为主，振臂一呼，举起了复兴镰仓、打倒幕府的大旗，远近诸国公方的旧臣、有志的浪人纷纷聚集到结城城，准备和幕府大战，这便是“永享之乱”的余震“结城合战”，连远在奥州的武士都响应了结城父子的义举，他们把那个在“永享之乱”中投靠幕府的筱川御所足利满直的城堡包围起来，满直无奈下只得自杀——持氏这一家子又死掉一个。结城方决心固守结城城，和幕府打持久战，只要能坚持下去，必然赢得关东的人心，复兴镰仓公方家便不是幻想，他们绕着结城城挖了能浮起大船的大堀（堀，即壕沟），在塀（日本古代用木板夹土筑成的墙壁）上涂上泥巴防止火攻，并在城中储备了许多粮食和箭矢，还在周围的古河、关宿、野田修筑了小城堡互为犄角，可谓固若金汤。
足利义教命令在伊豆隐居的上杉宪实出山，并命现关东管领上杉清方、扇谷上杉持朝、犬悬上杉持房（禅秀之子，因在永享之乱中立下战功，被允许复兴犬悬家）、骏河守护今川范忠、信浓守护小笠原政康、甲斐守护武田信重、越后守护代长尾实景，共十万大军，杀奔结城城。征讨军总大将上杉清方跑到结城城下一看，好家伙，围着城的有两重大堀，连在四通八达的河川上，河边全被叛军插上了茂密的树桩，运粮的船只在大堀上自由来往，补给叛军。上杉清方决心不做强攻，先切断结城城四周的要道，再造起数丈高的井楼，把结城城长期围困，等待守城方粮尽。
围困一直持续到次年（永享十三年，嘉吉元年）四月十五日，这时结城城的粮食已经吃得差不多了，士兵开始动摇。上杉清方便把诸将召开，开始战前动员：“以往，日本攻城也有持续两年三年的，但那往往是五百一千人的作战规模，现在日本一半的兵力在我们这里，攻一座城池攻了快一年，在这样下去只会辜负‘京公方’（与镰仓公方相对，指在京都的将军）的期待，国家也会不堪重负。明日是吉日，我军要总攻结城城，一举将它拿下！”
十六日清晨，打着旗帜的幕府军从四面八方猛攻结城城，叛军虽然奋勇抵抗，但饿着肚子终究力亏，优势渐渐被上杉清方掌握。午后，幕府军点燃了结城城的木橹（箭楼），大火和浓烟顺风吹入城中，叛军受不了，开始往城东方向溃逃，许多人慌不择路，落入了他们挖好的大堀中活活溺死。叛军大将结城氏朝乘着骏马左冲右突，准备杀死上杉清方，结果受伤多处，力尽后下马自杀。氏朝的儿子持朝也力战不降，被甲斐守护武田信重斩杀。春王丸和安王丸这两孩子化装成女子，准备逃跑，结果被越后守护代长尾实景识破，兄弟俩全被捆了起来。
结城城陷落后的次日，上杉清方将讨取（日本武士杀死敌人称作讨取）叛军的首级密密麻麻排在城下，举行了“首实检”（日本古代战争的得胜方，会把敌人的首级排好，供大将检验）仪式。结果幕府征讨军许多人，看到叛军中许多首级或是自己朋友，或是自己亲人，居然哭声震天，给全场笼罩上一层悲哀的气氛。至于春王丸和安王丸，他们和结城父子的首级一起，在长尾实景的押送下，前往京都接受足利义教的惩办。但义教没耐性在京都见这兄弟俩，在去京都途中的美浓国垂井宿的金莲寺中，受义教密令的长尾实景，抽出刀来，把十三岁的春王丸和十二岁的安王丸杀害。
足利义教对“结城合战”的结果很满意——这下足利持氏一家算是断子绝孙了，也就是说镰仓公方的滴流全部死亡。但是足利义教当时还不知道，关东的公方奉公众们还藏着一个。
持氏的嫡长子足利义久自杀了，另外两个儿子春王丸和安王丸也在结城合战后被杀，这和足利持氏幼名相同的永寿王丸又是从哪里冒出来的？原来永寿王丸是足利持氏第五个儿子（足利持氏共有十一个儿子），诞生于永享十年（1438），结城合战时才四岁，因为过于年幼，才侥幸躲过了幕府的屠刀，被信浓佐久郡的大豪族大井持光收养，这时横空出世，一下子成为了关东土鳖的大旗。得知永寿王丸还活着的消息后，幕府管领田山持国为了安抚关东的人心，也支持让永寿王丸回到镰仓，复兴公方一脉。这样，宝德元年（1449），
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