左大臣（さだいじん）：太政官的长官，总裁太政官所有政务、宫中的典礼等，是朝廷事实上的最高责任者。没有武家叙任过该职，根据秦（中国）的"丞相府"一词，左右大臣也被称为左相府、右相府，简称左府殿、右府殿。
右大臣（うだいじん）：太政官的长官，虽然是次席，但权限与左大臣相同。当左大臣因为某些原因不能出朝或兼任关白时，代行总裁太政官的政务和典礼。织田信长、德川家康、丰臣秀赖都叙任过此职。
内大臣：太政官编制之外的大臣，权限与前两者也是一样。当左右大臣都不能出朝时，代行总裁太政官的政务和典礼。德川家康叙任该职时，被称为"江户内府殿"，织田信雄、丰臣秀赖也曾叙任该职。
大纳言（だいなごん）：太政官的首席次官，与大臣共同商讨天下政事，讨论天皇命令的得当与否，也是传达上下言语的重职。大臣不在之时代行太政官的任务，丰臣政权下的羽柴秀长（大和大纳言）、前田利家、丰臣秀次等叙任此职。
中纳言（ちゅうなごん）：职务与大纳言相同，但不能代行大臣之事，中纳言的别称是"黄门"，原本由来是秦的官职，宫门之扉为黄色，此官于门内侍立所致。姊小路良赖曾向朝廷申请未果。
参议：与大臣、纳言共同协商政事的官职，是继纳言之下的重职，任用条件相当严格。参议的别称是唐名的"宰相"。足利义辉、足利义昭、北皇具教（参议左中将）等与朝廷亲近者叙任该职。
弁官局（べんかん）：分左右两部管理八省的部门。左右弁官局中有大弁、中弁、小弁之职。职务是将上命传达各省，处理庶务。因为要处理太政官内的一切公文，因此非学问出众者不能当此职。战国时代公家多有叙任此职者。
少纳言（しょうなごん）：最初是担当诏敕（天皇文书）的重职，后来职权衰减，成为仅仅掌管御印（内印）和官印（太政官印）的有名无实的官职。
长官：太政大臣·左大臣·右大臣
次官：大纳言·中纳言
判官：弁官·少纳言
八省内务省：（又称中务省）侍奉天皇侧近，行使诏敕颁行等宫中一切政务，卿由亲王担任，如无适任者即空缺。秀吉的御咄众宫部继润担任内务卿法印。
侍从是天皇的近侍，职务是进谏天皇的过错，补其不足。北羽的安东爱季屡屡向织田信长赠送鹰、马、天鹅等物，在信长的推举下叙任该职。
长官：内务卿（なかつかさきょう）
次官：内务大辅（なかつかさたいふ）·内务少辅（かつかさのしょう）
判官：内务丞（なかつかさのじょう）
他：侍従（じじゅう）
式部省：担任文官任免等一般人事的部门，负责调查文官的事务成绩，上报太政官，以及指导礼仪等工作。卿由亲王担任。信长的右笔（书记）楠正虎叙任式部卿法印一职。
长官：式部卿（しきぶきょう）
次官：式部大辅（しきぶたいふ）·式部少辅（しきぶのしょう）
判官：式部丞（しきぶのじょう）·式部大夫（しきぶのたゆう）
民部省：管理地方户籍、租税、交通、建设等工作的部门。因为是担当朝廷的税收工作，因此是仅次于内务、式部的要职。五奉行的前田玄以叙任民部卿法印，谒见秀吉的松前庆广担任民部大辅，秀吉的黄母衣众青山一重担任民部少辅一职。
长官：民部卿（みんぶきょう）
次官：民部大辅（みんぶたいふ）·民部少辅（みんぶのしょう）
判官：民部丞（みんぶのじょう）·民部大夫（みんぶのたゆう）
治部省：处理外交事务、高官的户籍管理、监督寺社佛阁等处人员的礼仪，也裁判庶民的婚姻诉讼。石田三成叙任治部少辅之事非常有名。
长官：治部卿（じぶきょう）
次官：治部大辅（じぶたいふ）·治部少辅（じぶのしょう）
判官：治部丞（じぶのじょう）
兵部省：管理武官的人事、诸国的兵马、城池等一切军务的部门，负责录用京和地方的兵士，制成名簿。大内义隆叙任兵部卿。
长官：兵部卿（ひょうぶきょう）
次官：兵部大辅（ひょうぶたいふ）·兵部少辅（ひょうぶのしょう）
判官：兵部丞（ひょうぶのじょう）
刑部省：管理诉讼的审理、判决、刑罚执行的部门，后因为检非违使厅的崛起，职权旁移，成为有名无实的官职。大谷吉继叙任刑部少辅一职。
长官：刑部卿（ぎょうぶきょう）
次官：刑部大辅（ぎょうぶたいふ）·刑部少辅（ぎょうぶのしょう）
判官：刑部丞（ぎょうぶのじょう）
大藏省：管理诸官厅的收支、诸国的调（田地课税）、货币、金银、物价的部门。
长官：大蔵卿（おおくらきょう）
次官：大蔵大辅（おおくらたいふ）·大蔵少辅（おおくらのしょう）
判官：大蔵丞（おおくらのじょう）·大蔵大夫（おおくらのたゆう）
宫内省：总管皇室的收支、衣食、杂务等宫中之事，同时也兼管诸国献上的食料和御料地（皇室直辖领）。
长官：宫内卿（くないき
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