南直隶：元属江浙行中书省、淮南江北行中书省、河南江北行中书省。
龙凤元年(元至正十五年，1355)太平路改置太平府；
二年(1356)集庆路、镇江路、广德路分别改置应天府、江淮府、广兴府；
同年宋置江南行中书省，治应天府，辖应天府、太平府、江淮府、广兴府、常州路、扬州路、庐州路、安庆路；
同年江淮府更名镇江府；
三年(1357)常州路改置长春府，寻更名常州府；宁国路、徽州路分别改置宁国府、新安府来属；扬州路改置淮
海府；
六年(1360)信州路改置广信府，与铅山直隶州来属；
七年(1361)宁国府更名宣城府；池州路改置九华府，寻更名池州府来属；安庆路改置宁江府；淮海府更名维扬
府；饶州路改置鄱阳府来属；
八年(1362)宁江府更名安庆府；鄱阳府更名饶州府，与广信府、铅山直隶州另属江西行省；
十年(1364)置中书省，省江南行省入，所辖直属中书省，俗称直隶；
同年置江淮行中书省，治庐州府，庐州路改置庐州府来属江淮行省；
十二年(1366)维扬府、宣城府分别更名扬州府、宣州府；淮安路、高邮府、安丰路来属江淮行省；
同年省江淮行省入中书省，同时安丰路、淮安路分别改置寿春府、淮安府；同年湖州路、嘉兴路分别改置湖州府、
嘉兴府来属；
吴元年(1367)寿春府降散州，濠州升临濠府；新安府、宣州府分别更名徽州府、宁国府；平江路改置苏州府，
与松江府来属；
洪武元年(1368)高邮府降散州；同年定应天府为南京，为国都；
二年(1369)定临濠府为中都，泗州、寿州分别升泗州直隶州、寿州直隶州；
四年(1371)泗州直隶州、寿州直隶州俱降散州；广兴府降广德直隶州；
六年(1373)临濠府更名中立府；七年(1374)中立府更名凤阳府；
十一年(1378)改南京为京师；
十三年(1380)废中书省，中书省直辖府州改为直属六部，仍俗称直隶；
十四年(1381)徐州升为徐州直隶州；湖州府、嘉兴府另属浙江行省；
二十二年(1389)和州、滁州分别升和州直隶州、滁州直隶州；
永乐十九年(1421)改京师为南京，直隶改称南直隶；
洪熙元年(1425)复改南京为京师；
正统六年(1441)复改京师为南京；
万历末年常州府更名尝州府。
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应天府：元为集庆路。龙凤二年(1356)改置应天府，同年属行省；洪武元年(1368)定为南京，十一年(1378)改称京
师；永乐十九年(1421)复称南京，洪熙元年(1425)复称京师，正统六年(1441)又复称南京。
上元县：倚郭[府东北偏]。龙凤二年(1356)徙治淳化镇，三年(1257)复徙治府城。东南有淳化镇巡司。
江宁县：倚郭[府西南偏]。东北有靖安河巡司，西南有大胜关、江宁镇巡司，西有江东巡司。
句容县：
溧阳县：元为溧阳州[无倚郭]。洪武二年(1369)降为溧阳县，仍属应天府。西北有上兴埠巡司，后废。
溧水县：元为溧水州[无倚郭]。洪武二年(1369)降为溧水县，仍属应天府。
高淳县：弘治四年(1491)析溧水县于高淳镇置高淳县，来属应天府。东有广通镇巡司。
江浦县：洪武九年(1376)析和州、滁州、六合县、江宁县于六合县浦子口城置江浦县，来属应天府，二十五年
(1392)徙治新开路口。东北有浦子口巡司，洪武九年废，二十五年复设；西南有西江口巡司。
六合县：元属扬州路真州。洪武二年(1369)直属扬州府，二十二年(1389)改属应天府。南偏东有瓜埠巡司。
凤阳府：元为濠州属安丰路。吴元年(1367)升为临濠府，直属中书省；洪武二年(1369)定为中都；六年(1373)更名
中立府，七年(1374)更名凤阳府，八年(1375)徙治凤阳县。
凤阳县：倚郭。洪武七年(1374)析临淮县于凤阳卫置凤阳县，来属凤阳府，八年(1375)徙凤阳府来治；十一年
(1378)析虹县一部来属。
临淮县：元钟离县为倚郭。洪武二年(1369)更名中立县，三年(1370)更名临淮县，八年(1375)凤阳府徙治凤阳
县，去倚郭名目。
怀远县：西南有洛河镇巡司。
定远县：
五河县：元属淮安路泗州。洪武四年(1371)改属临濠府。永乐元年(1403)自县南徙治县西北，嘉靖二十五年
(1546)徙治浍河北。西有上店巡司，后废。
虹县：元属淮安路泗州。洪武七年(1374)直属中立府。
寿州：元为安丰路。龙凤十二年(1366)属江淮行省，同年改置寿春府，直属中书省；吴元年(1367)降为寿州，
改属临濠府；洪武二年(1369)升为直隶州，直属中书省；四年(1371)复降为散州，复改属临濠府，并省
倚郭寿春县入州①。北有下蔡镇巡司，洪武二年置；东有北炉镇巡司，西偏南有正阳镇巡司。
霍丘县：南有西塔店巡司，南偏西有开
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