“9.11”事件以后，中亚地区军事和安全形势呈现出一系列新的变化。主要表现在中亚地区各国坚持独立自主的平衡务实外交有了新的进展；中亚地区的大部分国家继续与俄罗斯保持密切军事合作；中亚国家与美国的军事和安全全作进入新的阶段。但是美国和西方势力大规模进入中亚地区，对该地区未来的军事和安全形势影响深远。
中亚五国消除分歧，共同营造安全环境
新千年开始，中亚地区哈萨克斯坦、乌兹别克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦和土库曼斯坦五国政局基本保持稳定，各国的经济都在上一年经济增长的基础上进一步发展。各国在军事上注重与周边国家发展相互信任关系，双驼和多边军事政治关系不断改善。
2001年12月28日，乌兹别克斯坦、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦和塔吉克斯坦4国首脑在塔什干举行会谈，一致同意建立新的地区合作机构－“中亚合作组织”，以取代原有的“中亚经济共同体”。根据“中亚合作组织”发表的联合声明。建立该组织的目的是：进一步推动政治对话；完善地区经济一体化机制；加深在地区安全问题、为维护地区和平与稳定而采取共同行动问题上的相互谅解。
尽管如此，中亚地区的军事和安全形势并不稳固。塔吉克斯坦虽以结束内战，但政府与反对派之间的权力斗争从未止息，随时有可能发生“兵变”武装冲突。中亚国家民族、宗教矛盾依然尖锐，社会动荡和经济危机导致人民生活日益贫困，犯罪率居高不下，各种暴力事件屡有发生。
中亚各车俄罗斯继续保持密切军事合作
在独联体范围内与俄罗斯发展友好关系和安全合作是中亚国家军事、政治、外交的重点。面对日趋复杂的安全形势，中亚地区各国都希望加强统一的地区安全体制，特别是借助俄罗斯的军事力量保卫国家安全，为本国经济发展创造良好的外部环境。
中亚国家与美国的军事和安全合作进入新的阶段
新千年伊始，中亚地区各国在优先发展与俄罗斯传统关系的同时，加大了对西方外交力度。特别是加强了与超级大国美国的军事合作关系。
前苏联解体后，中亚地区成为一个新的独立的地缘空间。围绕中亚地区的安全保障问题，俄罗斯和美国之间展开了日趋激烈的争夺。在俄美中亚的争夺中，中亚的天平上不断的向美国倾斜。
由于美国的政治拉拢、经济利诱和安全承诺，中亚各国都认为在发展对俄罗斯关系的同时，加强与美国等西方国家的合作，可以获得更多的经济援助和更可靠的安全保障。事实上，在过去的几年中，各国除了配合美国的“中亚维和营”演习，已经开始大批地接受美国提供的军事培训、资金和军事技术装备，并表露出对美国插手中亚安全事务的欢迎。
“9.11”针对美国的恐怖袭击事件是中亚国家与美国实现军安全合作关系跃升的转折点。美国决定对阿富汗塔利班政权进行军事打击之后，先是乌兹别克斯坦成为美在中亚的主要军事伙伴，继而吉尔吉斯斯坦也正式与美签订提供军事基地的协定；吉尔吉斯斯坦在经过一段时间的观察后，也决定向美军提供机场；并不与阿富汗接壤的哈萨克斯坦也暗示“时刻准备”开放“领空和陆地”。以乌兹别克斯坦和美国签署军事合作协议、乌向美军开放汗纳巴德军用机场以及吉尔吉斯斯坦玛纳斯机场对美军开放为标志，美国在中亚地区实现了“军事进入”的历史性突破。
后又有消息传来，中亚国家考虑允许美国长期驻留。12月28日，在建立“中亚合作组织”的当天，乌兹别克斯坦总统公开宣称：美国在中亚四国的军事存在“没有时间限制”，“所有这些问题都将根据每个国家的利益和地区形势加以解决”。虽然塔、吉、哈三国的亲俄基本方针尚不致改变，但均显示了向美国倾斜的趋势。美国对阿富汗的军事行动和美欧迅速扩大的军事存在使中亚各国的处境及中亚地区的地缘政治格局都发生了新的变化。俄罗斯在中亚的主导地位因此受到严重的挑战。
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