中日矛盾的焦点无非是两条：1日本实际控制下的中国辽东半岛2中国实际控制下的日本权益。既然双方都不愿以战争解决，那么最实际的解决方案不外乎你控制你的，我控制我的。简单地说就是互相认可其实际控制区域。从这个角度来说，中方的提案是最接近双方底线的。
经过激烈的讨价还价，中日双方最终于9月底达成了和解协议。双方承诺，在不改变各自原则立场的前提下，维持现有的军事控制区；日本政府及日本国民在中国东北开设之企业、机构和不动产，全部交中方接管，人员由中方护送出境，中方给予日本政府经济补偿白银300万两，分10年支付。
局势稳定后，王啸飞向石铮提出，中日矛盾根深蒂固，来日必定会有一场大战，以东三省至关重要的战略地位，现有兵力尤恐不足，建议在东北地区就地征兵30万。石铮对此深以为然，但考虑到军费紧张，不宜大举扩军，指示王啸飞，可从主力部队中抽调人员组建成三个教导旅，先期训练30万民兵，藏军于民，以备来日之需。王啸飞受命后，把编练东北新军的工作交由江星辰负责。
东北问题解决后，西藏问题随之迎刃而解。早在共和革命初期，南京政府就派员赴拉萨与西藏地方接洽，要求其与清朝脱离关系。但当时国内局势复杂，地方当局态度暧mei。直到东北解放的消息传到拉萨，方才明确了立场，决定并入共和国版图。
共和国政府一如元、明、清三朝，继续册封*喇嘛、*额尔德尼两大活佛，使其获得在西藏地方的政治、宗教上的合法地位。同时建立西藏藏族自治区的行政区划，在拉萨设置自治区政府，自治区主席由西藏地方提名，中央政府批准。同时设立西藏民族事务公署，委派专员行使中央职权。基本上沿袭了清朝对西藏事务的管理制度。
至此，中国大定。
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