是外八庙中别具一格的庙宇。1964年，普佑寺因雷击起火，大部分建筑毁于火灾，当时仅存山门及四座配殿。
寺庙的建筑式样以汉族为主，但布局独特。步入山门，依次是大方广殿、天王殿等，大方广殿内供奉3尊藏密佛像，两侧塑有十六罗汉；西配殿中供文殊、观音、普贤三大士，东配殿中供奉金刚力士。
普佑寺与普宁寺围培相连，山门与普宁寺山门平行，面宽五楹，进深三间，两侧设腰门。山门正北是大方广殿，殿前檐联“妙相现庄严仁敷华梵，慧因资福德喜洽人天”；殿内题额“大千功德”。
有联“法演大乘妙因宗海藏，福覃诸界慈愿溥恒沙”。殿前东西为配殿，各三楹，组成一进院落。院落前为天王殿，面阔三楹，进深一间，单檐歇山顶，二进院落前为天王殿，面阔三楹，进深一间，单檐歇山顶，两侧设腰墙、腰门。
方形重檐攒尖顶，黄琉漓瓦覆顶。下有须弥座台基，北各出三阶，东西各出一阶，三排列柱沿方台环布，老檐柱间装菱花隔扇。南北正中三间、东西正中一间设门，其它各间设槛窗。上檐施七踩单翘单昂斗拱，向内收进两步架；下檐施五踩单翘单昂斗拱。
殿内施井口天花，四角用抹角梁，形成八角井口，中心起方形藻井。殿内供释迦牟尼鎏金铜佛，殿前有东西配殿各五楹。
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