当大木博士了解了两人的情况后，为化解矛盾，说“啊，你们快去选自己的口袋妖怪吧！别耽误了时间！”大木博士便推推搡搡的把两人带进了实验室。
进入实验室后，大木博士先给两人了五个红白相间的小球，和一台红色的机器，此机器呈一个手掌大小的长方形，右上角还有一个海蓝色的显示器。“这些是空的怪兽球，你们可以用它来捕捉野生的怪兽。而这个红色的机器便是口袋妖怪图鉴，你们在遇到口袋妖怪时，可以打开图鉴来查询。好了……”大木博士说到这里，停顿了一下，似乎是想起什么事了，他微微一笑，对小智和小茂说道：“小智、小茂啊！你们还记得，我在学校里教过你们什么吗？”“嗯？什么？”小智有点困惑，“口袋妖怪，与人类……”大木博士公布了答案，小茂不理解，“为什么现在提起这个？”。大木博士将双手往两人肩上一搭，望着前方说道：“你们应该知道，口袋妖怪与人类的关系。口袋妖怪也就是指除人类以外的其它生物，它们生活在池塘、草地、森林、大海、岩地，以及城市之中。它们与人类共同生活在这个蔚蓝色的星球上，与人类共同生活，共同工作，共同旅行……是人类最好的伙伴，它们拥有使人类走向成功的力量！”大木博士的语句中充满了感情，“嗯！”“嗯！”，小智与小茂也回应了大木博士的话。
“好了，现在你们就来选则自己初始的伙伴吧！”当大木博士按下一个开关后，位于实验室的正中间，放着的一台机器上的玻璃罩被打开了，一道白光闪过后，露出了三个怪兽球。“这里面分别装着的是：小火龙、杰尼龟、妙蛙种子。你们就在这三只中选一只吧。”“好！我先选！”话音刚落，小茂便拿起一个怪兽球按下了开关。“砰！”，一阵彩虹色的光芒闪过后，从球中放出了一只拥有淡黄色育成红色相间的外壳，蓝色身体，圆脑袋的——杰尼龟！“杰尼！”“啊，小茂选了杰尼龟呀！那么小智，你要选什么呢？”小茂笑道：“小智，你已经知道我选了什么了。我看你还是选一个对你有利点的吧！嘻嘻嘻......”“哼，我偏不选！”“砰！”同样是一阵彩虹色的光芒闪过后，小智放出了一只橙红色皮肤，恐龙样子的口袋妖怪，尾巴上还燃烧着熊熊的烈火，那就是传说中的——小火龙！！！“啊，小智！你要选小火龙吗？”大木博士十分疑惑的问道，他对小智逆天的行为感到十分不解，“当然，这样小茂不是就跟有利一点了吗?呵呵……（说出这句话时，感觉自己好帅啊~）”“什么！哼！”小茂十分气愤，将杰尼龟收进怪兽球后，便转身走了。“等等，小茂！”小智将小火龙收进球里后，也追了出去。但是小茂已经骑着自行车走了，“等等，等一下小茂！”小智边跑一边喊着，慢慢的离开了真新镇......大木博士看着两个少年的背影，会心的笑了。两个少年正怀着纯洁而冲动的心，向着昔日的黎明，前进！
【2】新的伙伴
真新镇郊区，“呼呼，累、累死我了！可恶的小茂，竟然骑自行车！哎，真倒霉，才刚开始就让他领先了！”孤身一人旅行的小智，在刚出发的第一天，就被竞争对手小茂领先了，现在正垂头丧气的走在郊区的路上。“难道我就是一个倒霉的人吗？”“扑！”说着说着，小智忽然踩到了什么东西。“额，这个感觉......软软的、绵绵的，有一种不想的感觉......"“化学成分分析中，”这时小智口袋中的图鉴发出了声音，“结果表明，此为小拉达的粪便！”“什么！”听到结果后的小智以迅雷不及掩耳之势闪了开来，“真霉，居然还倒小拉达屎运~~~~(_)~~~~”“拉达拉达！”“嗯？什么东西?"小智闻声望去，看见一只拥有紫色和白色皮毛，红色眼睛，长着又长又白又亮的门牙的小老鼠样子的口袋妖怪——小拉达正在草丛的另一边坏笑。“坏东西，肯定是你干的吧！哼，就让我来教训你！”小智愤怒的喊道。“去吧，小火龙！”随着一道红光闪过，小智从怪兽球中放出了小火龙。“就让你瞧一瞧我从大木博士那里得到的小火龙的威力吧！小火龙，使用【冲击】！”“火龙！”小火龙听到了命令，马上便冲向了小拉达，“拉达！”小拉达被狠狠的击中了。“哈哈，看见了吧！这就是你恶作剧的后果。”“拉——达！”突然间小拉达又站了起来，并以超快的速度攻向了小火龙，“火龙！”小火龙也没有料到，被小拉达击飞了！“啊！你没有事吧，小火龙？”小智关切的
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