对于朱由校的联姻提议，后水尾自然欢喜不得，有了明朝这个靠山他不但可以确保自己的地位，还能趁机夺回失去已久的权力。德川家光那边也是支持的，和子是他的妹妹，兴子是他的外甥，这两个女人将帮助他牢固的控制日本。只有织田信衡的内心是警惕的，他知道一旦江户幕府搭上明朝这条线，自己很有可能会成为一枚弃子，先前德川忠长的教训还历历在目。
当然这个提议也引起了朝廷内部的强烈反对，朱慈烺是嫡长子，身份贵不可言，大臣们已经要求立为太子，以保证大明国本的稳固。若是让他迎娶一位藩属国的皇室女子，这有悖于明朝的体统，弄不好还会影响他顺利的继承大统。
这些反对的奏折很快便淹没了司礼监的文案，曹化淳心知兹事体大，非他一人可以处理，索性又把这些奏折抬到上书房内，谨慎的说道：
“万岁爷，内臣不得干政是太祖高皇帝的遗训，此事涉及国本奴才不敢妄言，一切全凭主子定夺。”
朱由校抬头看了一眼曹化淳，见他脸色煞白暗暗发笑，心想你这个鬼机灵反应倒是挺快，可此时你不替我挡枪要你何用，于是故意拉长脸说道：
“前方的战报每日不下数百件，朕哪里还有精力？你且把这些东西抬回去，一切等落日行动结束后再议。”
曹化淳见皇帝语气坚定，犹豫了片刻后将到嘴边的话又咽了回去，一脸惆怅的起身告退。他知道这个黑锅不好背，说不定就会成为千夫所指，将来被发配到南海子净军也未可知。
等他走后，朱由校望着龙案的几封奏折一筹莫展。落日行动原本是要在十年后进行的，谁知半路杀出了四国联军，朱由校认为机不可失，这才提前介入日本的内乱。如今这场战争已经超出了他的预期，织田和德川两大家族为了赢得最后的胜利，不惜放纵部下抢夺粮草和壮劳力，导致日本境内的春耕荒废，流民四起，饿殍遍野。
为了寻找一线生机，这些难民有的往北逃至北海道和库页岛，还有的偷渡到九州岛希望得到明朝的庇护。其实接收难民并不麻烦，关键是要有足够的粮食，明军跨海作战后勤补给本就困难，哪里会有多余的物资养活他们？
为此商周祚在皇帝的授意下，只留下有手艺的工匠、矮于车轮的孩童，以及三十岁以下的女人，其余全部转手卖给约瑟夫。这些英格兰人名义上是招工，其实就是诱骗免费的劳动力到美洲淘金，属于早期的贩奴贸易。这种方式虽然简单粗暴，但是对于他们来说却是最好的选择。
同样的问题也发生在明朝内部，由于魏忠贤将三饷摊派到全国各地，这使得自然环境本就非常恶劣的西北雪上加霜。天启六年这里遭遇罕见的干旱，后来又出现蝗灾，致使田地几乎绝产。当地百姓为了生计被迫前往陕西、河南、四川讨饭，沿途怨声载道，苦不堪言。
为了缓解灾情，西北总督卢象升四次上奏折请求取消征收甘肃、宁夏的三饷，并要求朝廷拨款赈灾，开放粮仓周济灾民。同时安排甘肃巡抚左光斗、总兵罗乾象加强警备，防止流民趁机作乱。
魏忠贤接到的命令是不惜一切代价凑齐军饷，自然不会同意卢象升的提议，两人势如水火，一时难分胜负。可是入秋以后，流民越聚越多，西北各州县经常出现打家劫舍的情况，治安压力非常大。那些脑袋上长着反骨的阴谋家趁机煽动难民闹事，高迎祥、罗汝才、李自成等陆续登上历史的舞台。
按照大明律例，各地巡抚要如实奏报叛乱的情况，朝廷也有一套成熟的制度应对，但落日行动马上要进入第二阶段，这个时候跟皇帝说发生叛乱无异于找死。午朝时孙承宗、韩爌、黄克缵、李邦华、朱燮元等一干老臣面色沉重，不知该如何开口，朱由校虽然已经得到戚兴国的密报，却也装作不知。最后还是敢于仗义执言的郑三俊站了出来，俯首嚎啕大哭的说道：
“启奏陛下，讨伐倭寇的战争已达成预期的目标，说明王师天道昭昭，列祖列宗有在天之灵。可是今年西北旱情严重，庄稼几乎绝产，若继续在当地征收三饷，微臣担心像高迎祥、罗汝才等贼人的叛乱会越来越多。”
朱由校听完假装非常吃惊，愤怒的拍了下桌子，大声责问道：
“诸位爱卿，郑大人此话是何意？”
韩爌见郑三俊已经向皇帝摊牌，自知身为内阁首辅有不可推卸的责任，索性将西北的局势一股脑的交代清楚。朱由校表面上越听越气，咬牙切齿的咒骂魏忠贤祸国殃民，发誓要将这个狗奴才拖到午门枪毙半个小时。不过他内心则是一阵狂喜，该来的总会来，终于等到你，还好没放弃。
花开两朵，各表一枝。高迎祥造反的才华在动乱的西北发挥的淋漓尽致，逮住机会便劝说流民与其坐而饥死，何不盗而死？加上整个朝廷已经迁至南京，皇帝正在全力指挥讨倭的战争，他认为这是绝佳的机会，带领手下的得力干将一路往东前进。攻克汉中后将瑞王府劫掠一空，又命部下把王府内外杀的鸡犬不留，以此断绝众人的退路。
瑞王府的惨案很快便传到南京，这让朱由校非常恼火，责令卢象升火速驰援汉中，并安排曹文诏、罗乾象、艾万年从三面夹击这股叛军。眼见官军来势汹汹，高迎祥自知无法正面迎战，便在磨盘山与罗汝才、横天王、九条龙等人合兵一处，进入防守比较薄弱
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