待将士们都吃上饭后，张煌言方才吃了张面饼，又急急召集部将商议破敌之策。这时，一条明军快船从清军左侧绕过来，驶入中军战船。船上的军士是张名扬派出的信使，登上大船后，递给张煌言一封信函，报告道：“张大人，清虏已于二十二日攻至舟山城下，刘世勋大人请你速回救援！这是他的亲笔信。”
张煌言拆开信函，确认是刘世勋的笔迹，仔细看完信后，大惊道：“舟山是朝廷的根本，不容有失！为何荡胡侯的水师没能挡得住清虏？”信使道：“昨日，舟山海面起了大雾，两船不能相视。清虏趁涨潮渡海，被我军发现。荡胡侯统领战船迎敌，在横水洋拦住清虏，双方互射火炮，战况极为激烈。荡胡侯身先士卒，指挥所乘战船带头冲锋，直攻清虏主将金砺的座船。靠近后，荡胡侯把火球扔向金砺的座船，不料火球撞在桅杆上，随即反弹回来，落入荡胡侯的战船上，顿时引起大火。清虏趁机进攻，我军伤亡惨重，只有两条船逃回舟山。荡胡侯被火烧伤，跳入海中，却被清虏擒获，因伤重而死。清虏进抵舟山后，分兵一半登陆攻城，另一半在海上拦截援军。”
张煌言叹息道：“荡胡侯怎么能如此粗心大意？稀里糊涂地送了自家性命，还折损了水军，致使舟山城失去了保护。”随即面色变得严峻，问道：“刘大人有没有派人请鲁王监国、定西候回师？”信使道：“信使已经出发了，若是没有意外，应该能追上。”张煌言向众将严肃说道：“清虏已经兵临舟山城下，我军一定要冲破清虏的拦截，速去救援舟山。”立即令亲兵挥动军旗，调动战船向清军杀去。
明军攻势如潮，可是清军死战不退，紧紧缠住明军。接连数日，双方打得难解难分。张煌言心急如焚，苦于突破不了清军阴挡，嘴上起了堆水泡。将士们担心城里家属的安危，亦是急不可待地想返回舟山。
九月初二日，明军只剩下六十多艘战船，其中有十艘战船风帆损坏，只能靠士兵们划桨前进。张煌言忧心道：“舟山城里仅有营兵五百、义勇千人，火药军资亦不充足。清虏已经攻城十日，不知城中情形如何？”葛明安慰道：“既然清虏拼命阻挡我军，说明舟山城尚未被攻破。”张煌言坚定地说道：“舟山城危在旦夕，今日无论如何要赶到舟山。”
葛明急忙献计道：“张大人，我军可先向东航行，绕过普陀山岛，再到舟山。”张煌言道：“由此向东水路复杂，再者多费时间，耽误了救援。”戚玉看着洋流滚滚，思得一计，急忙说道：“张大人，我军可使用火船之法。”张煌言道：“我军没有小船，如何使用火船？请葛夫人详细道来。”戚玉便讲了火船使用之法。张煌言大喜，立即安排将士们准备战斗事宜。
过了半个时辰，明军发起了猛烈进攻，清军立即调动战船拦截。在明军战船阵后，将士们把没有船帆的十艘战船摇到洋流上方，然后点着了火。船上浇了火油，瞬时就燃起了大火，愈燃愈烈，烟火冲天，顺着洋流向清军船队飘去。船上的明军将士们跳入海中，游到附近的战船上。
火船顺流飘入清军船队中，径直向清军战船撞去，吓得清兵们纷纷驾船躲闪。无奈火船顺流飘行，清军战船躲闪不及，有五艘被撞上，随即起火燃烧。其余战船纷纷调整航向，驶到这股洋流之外。明军趁着清军慌乱之际，驾船冲破清军战船拦截，迅速向舟山驶去。
行至距离舟山六十里的火烧门时，只见前方有大片战船驶来。张煌言见船上飘着“张”字大旗，喜道：“定西侯亦率军回援舟山！”急忙派亲兵乘快船去与张名振联络。待亲兵返回禀报后，方才得知鲁王、张名振率军大破吴淞清军水师，击毁清军战船八十多艘，听闻清军攻打舟山，便返航支援，途中亦受到清军水师的阻击。
两军会师后，张煌言登上张名振的指挥船，拜见鲁王，报告了战斗经过。鲁王哭道：“舟山已不能支撑，二位爱卿赶快领兵救援！”张名振急忙安慰道：“殿下放心！臣这就指挥大军出击。”立即下令全军向舟山进发。行至舟山附近道头海域时，舟山城里传来隆隆炮声。三百多艘清军战船蜂拥驶来，顽强抵抗明军。双方铳炮对射，打得甚是激烈。
一个时辰过后，突然传来雷鸣般的爆炸声，但见舟山城上空烟焰遮天蔽日。将士们猜得舟山城已破，皆失声痛哭。清军欢声雷动，趁势向明军进攻。张名振大怒，指挥将士们奋勇还击，打得清军向舟山城退去。不到两个时辰，有两艘小船驶来，船上有六个从舟山城逃出的明军士兵。
这些士兵被带到中军船上，报告了城中情况。原来清军久攻舟山城不下，便在城墙下挖掘地道，放入火药，崩塌城墙。刘世勋、张名扬、马泰率军巷战，力尽阵亡，舟山城遂告失守。鲁王监国正妃陈氏等投井而死，西宫妃荣氏和世子留哥被清军俘杀；大学士张肯堂、礼部尚书吴钟峦、兵部尚书李向中等人自杀殉国；张名振全家举火自焚而死。总兵金允彦、巡城主事邱元吉、总督部院李长祥等人向清军投降。清军入城后，大肆屠杀军民，一万多人惨遭杀害。
鲁王站立船头，凝望着舟山城，泪如雨下，大哭道：“孤不能保护子民，有何颜面活于世上？”抽出宝剑便要自刎，被众将苦苦劝住。张名振悔恨不已，恸哭道：“臣误国误家，死不足赎！”
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